总体对比
表1. 宏病毒组V 1.0和V 2.0对比
宏病毒组2.0
宏病毒组2.0版本分析中增加了多样性分析(α-多样性和β-多样性分析)、统计分析(LEfSe分析和组间差异显著性检验)和病毒宿主预测分析。对于高级分析和个性分析中的噬菌体宿主预测存在差别;在高级分析中,所展示的结果是表格信息,可以根据样本数据的特点和样本数量等评估是否可以进行个性化的视图展示,详见个性分析中结果图5。
图1. 宏病毒组2.0分析流程图
细谈个性分析
新病毒基因组组装
自然界种存在着大量未知的病毒,是构成生态系统的重要基础,而我们对于病毒的研究受限于无法有效的分离出病毒,基因组学研究为探索病毒的奥秘提供了有效的方法,尤其是不依赖培养的宏病毒技术,在病毒基因组组装工作中有着决定性优势。目前已经组装得到病毒类型包括:RNA病毒、ssDNA病毒、dsDNA病毒组装得到新病毒基因组后,通过与已知病毒共同构建系统发育树,可以确定新病毒的系统发育地位。
图2. 新病毒基因组系统发育树分析
目的基因分析
图3. 特定目的基因谱系分析
图4. 特定目的基因功能结构域分析
图5. 病毒宿主预测分析