a级黄色片宏基因组产品升级引入Nanopore平台助力宏基因组三代测序，新增“三+二”宏基因组测序策略读长更长、组装更佳、更全面获取微生物物种的全基因组序列。
一、产品优势
1、更真实反映菌群实际组成
a级黄色片三代宏基因组采用“三+二”测序策略，三代宏基因组测序策略解决了二代读长短的限制，能轻松覆盖基因间区或基因特异性区域，长读长Reads能够更为精准地鉴定水体、土壤、肠道等生境中微生物的种类，有效提高微生物群落鉴定的分辨率，更加真实的反映菌群的实际组成。
2、组装效果更佳
①高质量组装：Contig N50增长超过60%，轻松解决组装问题
②更精确预测：基因数量提升16%，多获得30%完整基因
③个性化分析：Bins数量提高17%，实现高质量草图“0”的突破
注：以上数值均从测试数据中得出，具体以实际项目情况为准
二、产品测试
a级黄色片对环境类样本分别进行二代和三代（NovaSeq+Nanopore）建库测序分析，二代的数据同时用于三代数据的校正和独立组装，然后再与三代的组装结果进行聚类得到最终的组装结果。从以下三个方面比较纯二代宏基因组与“三+二”宏基因组的差别。
1、组装结果比较
在10G二代测序数据的基础上增加了3G三代的数据来进行组装，得到的contig数量相当，并且N50提高了60%以上。
2、基因数量和完整性
Intergrity（%）：完整基因数量/total基因数量；完整基因：基因序列同时含有启动子和终止子。
在三代+二代的测序策略下，组装得到的基因数量明显增加，并且完整基因的占比也明显增加。
3、Binning分析
由上表数据可知，在三代+二代的测序策略下，bins的数量和质量都有明显提高。
综上可得，与纯二代宏基因组相比，“三+二”宏基因组的测序组装结果从N50、基因数量和完整性、基因组Binning数量和质量上都有明显的提高。
三、产品详情
1、分析流程
2、产品参数
3、个性化分析结果展示
目的MAGs与已发表的陆地元基因组数据的比较[1]
目的基因簇的相互关系网络图[2]
目的基因功能结构域分析[2]
目的基因的宿主范围[3]
不同样本季节的物种群落相对丰度和差异分析[4]
注：以上个性化分析图片来源于前沿文献，仅供研究思路参考，具体分析结果以实际交付的结题报告为准。
参考文献：
[1]Complementary Metagenomic Approaches Improve Reconstruction of Microbial Diversity in a Forest Soil
[2]Novel soil bacteria possess diverse genes for secondary metabolite biosynthesis
[3]Mobile antibiotic resistome in wastewater treatment plants revealed by Nanopore metagenomic sequencing
[4]Comparative genome-centric analysis reveals seasonal variation in the function of coral reef microbiomes
如对本产品感兴趣可拨打我们的热线电话：400-968-5700
读长更长、组装更佳“三+二”宏基因组测序策略，助您更全面获取微生物物种的全基因组序列！
致尊敬的您：a级黄色片专注微生物组学领域，不断拓展基因组学在环境、生态、农业和医学健康领域的应用，持续开发国际领先的产品和服务，致力于成为全球领先的微生物组学产品和服务提供者。
公司已开拓的业务领域有：16S/18S/ITS测序 ; 16S全长测序；GeoChip、宏基因组、宏转录组、宏病毒组测序；单菌框架图、完成图。
目前已为清华大学、中国科学院、中山大学、浙江大学、美国佐治亚理工学院、香港科技大学等国内外众多科研学术机构提供了全方位的科研服务，在行业内具备显著影响力。如您有任何需求和疑问，欢迎随时咨询，a级黄色片竭诚为您服务！
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